主治醫師勞動權益不保，病人健康也不保
主治醫師沒有『勞基法』保障，被迫離職，勞動權益不保。病人找不到醫師，健康不保。前彰基皮膚科醫師邱足滿被迫離職，病人找不到她，沒有治病，影響健康。
陳堯俐：離開彰基路更寬
彰基醫師和員工突然被調動職務和工作地點，有人在2年內調職4次，因為無法適應，壓力大到夜裡做惡夢，甚至想要在院內自殺；有的醫師在院務會議，當眾被院長陳穆寬責罵業績是全院最差；還有醫師使用的儀器，被院方收走，影響工作。
彰基醫學中心獲利不及地區醫院級分院？
觀察彰化基督教醫院與員林基督教醫院、鹿港基督教醫院2家分院在2019年的財報，可以發現員基醫務獲利2.72億元、獲利率是8%，鹿基為1.51億元、獲利率是9%，這2家地區醫院的醫務獲利能力明顯超過醫學中心等級的彰基總院。
彰基院長陳穆寬的改革之路遭員工質疑
彰基院長陳穆寬醫界傳說，他趕走資深主治醫師，全院幾乎變成他一個人的耳鼻喉科專科醫學中心，對離開的資深醫師來說，彰基變成了專「剋」醫師中心。他打著改革名義，任意調動醫師工作地點和門診時段，排擠某些醫師的手術時段，因而延後病人的開刀治療時間。
讓醫師變醫奴的定期聘僱契約
一名高雄住院醫師與醫院約定，完成訓練，即返回母院，貢獻所學。可是，院方沒有給予事前承諾的職缺，還安排極為繁重的工作，導致心律不整、高血壓，身心俱疲。他的夜班增加到11班，2週工時共185小時，還得在36小時內往返母院、偏鄉衛生所支援。他想要離職，卻要賠償600多萬元的離職違約金。
